Historia MKS-u Kalisz jako klubu piłki ręcznej rozpoczyna się w 2007 roku, wraz z przystąpieniem do rozgrywek II ligi. Kontekst wokół powstania drużyny był jednak inny niż w większości takich przypadków. Późniejszy, ciężko wywalczony awans do krajowej elity był ważnym osiągnięciem, jednak Kaliszanie mogli czuć się tam jak w domu. Wszystko z powodu historii tej dyscypliny w naszym kraju, ściśle łączącej się ze Szczypiornem – obecnie dzielnicą Kalisza. W Polsce pierwsze mecze miały odbywać się w gronie oficerów I i III brygady Legionów Polskich internowanych w czasie tzw. kryzysu przysięgowego właśnie w Szczypiornie (stąd nazwa szczyporniak).
Współczesne realia nie były, przynajmniej na początku, łagodne. MKS rozpoczynając rozgrywki
w drugiej lidze miał do przebycia długą drogę. Awans udało się uzyskać dopiero w sezonie 2011/12 dzięki zajęciu 2 miejsca. W rozgrywkach barażowych kaliszanie pokonali Wisłę Sandomierz i przegrali z ŚKPR Świdnica. Taki wynik nie premiowałby drużyny z Kalisza, jednak ZPRP zarządził powiększenie I ligi. Stały rozwój i stabilizacja na wyższym szczeblu połączone ze zmianami organizacyjnymi po kilku latach stworzyły szanse na awans do Superligi. Plan został zrealizowany w sezonie 2016/17, dzięki wygraniu 21 meczów, przy ledwie 4 porażkach. Miasto od początku związane z piłką ręczną wprowadziło swojego reprezentanta do najwyższej klasy rozgrywkowej
w sezonie jubileuszu 100-lecia dyscypliny w Polsce. Największym sukcesem MKS-u jest półfinał Pucharu Polski 2018/19.
